MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 1801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007490	TGC	2	6	185	190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530954
2	NC_007490	GT	3	6	196	201	0 %	50 %	50 %	0 %	552530954
3	NC_007490	CCT	2	6	246	251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530954
4	NC_007490	CTC	2	6	280	285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530954
5	NC_007490	ACC	2	6	331	336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530954
6	NC_007490	TCC	2	6	349	354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530954
7	NC_007490	CCGC	2	8	361	368	0 %	0 %	25 %	75 %	552530954
8	NC_007490	CGC	2	6	373	378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530954
9	NC_007490	TCCT	2	8	397	404	0 %	50 %	0 %	50 %	552530954
10	NC_007490	C	6	6	446	451	0 %	0 %	0 %	100 %	552530954
11	NC_007490	AGA	2	6	455	460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	552530954
12	NC_007490	CCGA	2	8	481	488	25 %	0 %	25 %	50 %	552530954
13	NC_007490	CGA	2	6	492	497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530954
14	NC_007490	TCA	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530954
15	NC_007490	GCG	2	6	536	541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530954
16	NC_007490	CGGC	2	8	542	549	0 %	0 %	50 %	50 %	552530954
17	NC_007490	ACC	2	6	560	565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530954
18	NC_007490	CCCCG	2	10	581	590	0 %	0 %	20 %	80 %	552530954
19	NC_007490	CGC	2	6	633	638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530954
20	NC_007490	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530954
21	NC_007490	ATC	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530954
22	NC_007490	CG	3	6	707	712	0 %	0 %	50 %	50 %	552530954
23	NC_007490	GGCT	2	8	855	862	0 %	25 %	50 %	25 %	552530954
24	NC_007490	CGCAG	2	10	936	945	20 %	0 %	40 %	40 %	552530954
25	NC_007490	GGC	2	6	999	1004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530954
26	NC_007490	GCT	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404778
27	NC_007490	ACG	3	9	3211	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404778
28	NC_007490	ATG	2	6	3223	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404778
29	NC_007490	GC	3	6	3247	3252	0 %	0 %	50 %	50 %	77404778
30	NC_007490	GCA	2	6	3285	3290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404778
31	NC_007490	ACT	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404778
32	NC_007490	CAC	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404778
33	NC_007490	AGA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404778
34	NC_007490	GCT	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404778
35	NC_007490	GCG	2	6	3532	3537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404778
36	NC_007490	ATG	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404778
37	NC_007490	CGG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404778
38	NC_007490	CAA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404778
39	NC_007490	CTG	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404778
40	NC_007490	GAG	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404778
41	NC_007490	GAAG	2	8	3822	3829	50 %	0 %	50 %	0 %	77404778
42	NC_007490	CTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404778
43	NC_007490	CAT	2	6	3870	3875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404778
44	NC_007490	GAGC	2	8	3879	3886	25 %	0 %	50 %	25 %	77404778
45	NC_007490	GAA	2	6	3890	3895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404778
46	NC_007490	AGG	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530955
47	NC_007490	GCCG	2	8	4043	4050	0 %	0 %	50 %	50 %	552530955
48	NC_007490	CG	3	6	4081	4086	0 %	0 %	50 %	50 %	552530955
49	NC_007490	CGCGG	2	10	4108	4117	0 %	0 %	60 %	40 %	552530955
50	NC_007490	CCA	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530955
51	NC_007490	TTG	2	6	4173	4178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	552530955
52	NC_007490	TCGA	2	8	4195	4202	25 %	25 %	25 %	25 %	552530955
53	NC_007490	CTG	2	6	4212	4217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530955
54	NC_007490	TCA	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530955
55	NC_007490	GCG	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530955
56	NC_007490	TGC	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530955
57	NC_007490	GCT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530955
58	NC_007490	CAA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	552530955
59	NC_007490	TGA	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	552530955
60	NC_007490	CTA	2	6	4451	4456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530955
61	NC_007490	TCCG	2	8	4611	4618	0 %	25 %	25 %	50 %	552530956
62	NC_007490	CTG	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530956
63	NC_007490	CACGC	2	10	4691	4700	20 %	0 %	20 %	60 %	552530956
64	NC_007490	AGC	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530956
65	NC_007490	CCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530956
66	NC_007490	GC	3	6	4918	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	552530957
67	NC_007490	GCA	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530957
68	NC_007490	CCA	2	6	4966	4971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530957
69	NC_007490	GAG	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530957
70	NC_007490	AGA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	552530957
71	NC_007490	CGC	2	6	5118	5123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530957
72	NC_007490	GAG	2	6	5149	5154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530957
73	NC_007490	CGG	2	6	5241	5246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530958
74	NC_007490	GTG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	552530958
75	NC_007490	AG	3	6	5935	5940	50 %	0 %	50 %	0 %	552530959
76	NC_007490	CGC	2	6	5955	5960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530959
77	NC_007490	GGC	2	6	6494	6499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530960
78	NC_007490	TCA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530960
79	NC_007490	GCC	2	6	6591	6596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530960
80	NC_007490	CTC	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530960
81	NC_007490	GCT	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530960
82	NC_007490	GCC	2	6	7361	7366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404779
83	NC_007490	ATG	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404779
84	NC_007490	AAC	2	6	7450	7455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404779
85	NC_007490	GC	3	6	7456	7461	0 %	0 %	50 %	50 %	77404779
86	NC_007490	GAC	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404779
87	NC_007490	GC	3	6	7488	7493	0 %	0 %	50 %	50 %	77404779
88	NC_007490	GC	4	8	7551	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	77404779
89	NC_007490	GGCG	2	8	7584	7591	0 %	0 %	75 %	25 %	77404779
90	NC_007490	AGG	2	6	7592	7597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404779
91	NC_007490	GCC	2	6	7602	7607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404779
92	NC_007490	TTTCGC	2	12	7608	7619	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	77404779
93	NC_007490	GGCC	2	8	7659	7666	0 %	0 %	50 %	50 %	77404779
94	NC_007490	ATG	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404779
95	NC_007490	CGG	2	6	7784	7789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404779
96	NC_007490	AGG	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404779
97	NC_007490	CGG	2	6	7796	7801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404779
98	NC_007490	GC	3	6	8030	8035	0 %	0 %	50 %	50 %	552530961
99	NC_007490	GCC	2	6	8046	8051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530961
100	NC_007490	CA	3	6	8057	8062	50 %	0 %	0 %	50 %	552530961
101	NC_007490	CCTT	2	8	8175	8182	0 %	50 %	0 %	50 %	77404780
102	NC_007490	GC	3	6	8205	8210	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
103	NC_007490	CCG	2	6	8232	8237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404780
104	NC_007490	CG	3	6	8293	8298	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
105	NC_007490	GC	3	6	8302	8307	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
106	NC_007490	GC	3	6	8351	8356	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
107	NC_007490	GCT	2	6	8365	8370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404780
108	NC_007490	GC	3	6	8414	8419	0 %	0 %	50 %	50 %	77404780
109	NC_007490	AGA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404780
110	NC_007490	GGC	2	6	8500	8505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404780
111	NC_007490	GGCCC	2	10	8525	8534	0 %	0 %	40 %	60 %	77404780
112	NC_007490	CCG	2	6	8543	8548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404780
113	NC_007490	GGC	2	6	8557	8562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404780
114	NC_007490	GC	3	6	8781	8786	0 %	0 %	50 %	50 %	552530962
115	NC_007490	GCC	2	6	8891	8896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530962
116	NC_007490	GGA	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530962
117	NC_007490	TGC	2	6	8955	8960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530962
118	NC_007490	CCCT	2	8	8975	8982	0 %	25 %	0 %	75 %	552530962
119	NC_007490	GGA	2	6	8992	8997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530962
120	NC_007490	GCCG	2	8	9028	9035	0 %	0 %	50 %	50 %	552530962
121	NC_007490	GCC	2	6	9080	9085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530962
122	NC_007490	CTC	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530962
123	NC_007490	TCA	2	6	9159	9164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530962
124	NC_007490	C	6	6	9198	9203	0 %	0 %	0 %	100 %	552530962
125	NC_007490	CGC	2	6	9240	9245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530963
126	NC_007490	GGC	2	6	9279	9284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530963
127	NC_007490	CGGC	2	8	9305	9312	0 %	0 %	50 %	50 %	552530963
128	NC_007490	GCC	3	9	9319	9327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530963
129	NC_007490	TCC	2	6	9340	9345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530963
130	NC_007490	CAGA	2	8	9380	9387	50 %	0 %	25 %	25 %	552530963
131	NC_007490	TCC	2	6	9388	9393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530963
132	NC_007490	GTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	552530963
133	NC_007490	CGGA	2	8	9422	9429	25 %	0 %	50 %	25 %	552530963
134	NC_007490	CCGCT	2	10	9456	9465	0 %	20 %	20 %	60 %	552530963
135	NC_007490	GCG	2	6	9466	9471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	552530963
136	NC_007490	CCGA	2	8	9564	9571	25 %	0 %	25 %	50 %	77404782
137	NC_007490	GGC	2	6	9585	9590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
138	NC_007490	GGC	2	6	9604	9609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404782
139	NC_007490	GC	3	6	9632	9637	0 %	0 %	50 %	50 %	77404782
140	NC_007490	GCC	2	6	9710	9715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404782
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172	NC_007490	CCA	2	6	11256	11261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404783
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251	NC_007490	GCAAC	2	10	17876	17885	40 %	0 %	20 %	40 %	552530964
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256	NC_007490	GGT	2	6	18289	18294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	552530964
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259	NC_007490	CCG	2	6	18349	18354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530964
260	NC_007490	GGA	2	6	18413	18418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	552530964
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262	NC_007490	ATG	2	6	18483	18488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	552530964
263	NC_007490	AG	3	6	18512	18517	50 %	0 %	50 %	0 %	552530964
264	NC_007490	GCC	2	6	18549	18554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	552530964
265	NC_007490	GA	3	6	18565	18570	50 %	0 %	50 %	0 %	552530964
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268	NC_007490	GCTCGG	2	12	18913	18924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404792
269	NC_007490	ACG	2	6	19028	19033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404792
270	NC_007490	GCA	2	6	19053	19058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404792
271	NC_007490	AC	3	6	19155	19160	50 %	0 %	0 %	50 %	77404792
272	NC_007490	CGGCG	2	10	19180	19189	0 %	0 %	60 %	40 %	77404792
273	NC_007490	GC	3	6	19256	19261	0 %	0 %	50 %	50 %	77404792
274	NC_007490	TGA	2	6	19272	19277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404792
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300	NC_007490	CCAG	2	8	20887	20894	25 %	0 %	25 %	50 %	77404794
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397	NC_007490	TCGC	2	8	25654	25661	0 %	25 %	25 %	50 %	77404797
398	NC_007490	GCCG	2	8	25674	25681	0 %	0 %	50 %	50 %	77404797
399	NC_007490	CGC	2	6	25756	25761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404797
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499	NC_007490	GC	4	8	35211	35218	0 %	0 %	50 %	50 %	77404805
500	NC_007490	CTC	2	6	35273	35278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404805

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